當前，長江流域的水污染造成的危害日益明顯，長江流域的水環境不容樂觀。據資料顯示，2000年與1999年相比，長江劣於三類水標準的河長佔總評價河長的26％，比1999年上升了5個多百分點，上升態勢明顯，其中，長江沿岸排污口的排污是造成污染帶的根本原因。1999年長江流域（包括太湖流域）工業廢水和城鎮生活污水為207億噸，佔全國廢污水排放總量的近三分之一。
由於投入不足等原因，不少城市生活污水處理設施建設滯後，根本不能適應水污染防治的要求。隨著重慶人口不斷增加，全市生活污水排放量增多，去年底達4億多噸，而全市僅有3個處理量較低的污水處理廠，全市污水處理率遠低於全國平均水平。
同時，垃圾正嚴重威脅著長江和三峽庫區的水環境。白色污染」不僅影響到長江水質，而且影響到國家重點水利工程的安全。1998年的特大洪水攜帶的大量垃圾，曾在葛洲壩前堆積成一道高度達2－4米的「垃圾山」，迫使電廠停機。此外，農業面源污染和船舶污染問題也日益突出，亟需採取措施解決。
長江流域500取水口受污染影響一些城市守著江水找水吃
靠近奔騰不歇的長江，但一些城市岸邊卻難以找到符合飲用水衛生標準的水源地。目前，由於水質型缺水危機，上海、重慶等城市正遭遇守著長江找水喝的尷尬處境。
長江流域水污染已對飲用水水質安全構成嚴重的危害。據統計,1999年長江流域（包括太湖流域）工業廢水和城鎮生活污水為207噸，佔全國廢污水排放總量的近三分之一。目前長江干流沿岸共有取水口近500個，都已不同程度地受到岸邊污染帶的影響，目前長江流域工業、城鎮生活用水量約600億噸，主要取自岸邊，由於找不到符合飲用水衛生標準的水源地，不少城市被迫採用江心取水辦法以改善飲用水質量。若都改從江心取水，需比原投資增加數十億元
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