複製人最大問題在於靈魂是否也可複製
假設複製人的科技已臻完美，最大的問題其實在於靈魂是否也可以複製？畢竟，人的生命不只有物質或肉體層面，也有精神或靈魂的層面。這是「創造生命」的技術面，恐怕永遠難以解決的問題。也因為太複雜、深奧，西方先進國的科學界甚至政治界乾脆採取「區隔」專業的做法，讓宗教界去傷腦筋。各主要宗教紛紛發聲，譴責科學家企圖逾越本分，企圖當創造萬物的上帝的想法。
科學界認為人類遲早將能夠以「複製技術」創造出健康的新生兒，這種自信，恐怕就是輕忽「靈魂」在生命中所扮演的角色所致。
雷爾教派宣稱已誕生的「現代夏娃」今後成長的歷程，勢將成為眾所矚目的焦點。她是三十一歲的媽媽用自己細胞的DNA注進挖空細胞核的卵子，成為「受孕」胚胎細胞，再植入她自己的子宮懷孕，成熟後剖腹生產而來。
如果「夏娃」誕生過程如雷爾教派所言不虛，她是基督教傳說裡面聖母瑪麗亞「無性生殖」耶穌以來，第一個單性繁殖的案例。光憑這點，就讓人驚服科技之「神」。
美國甚至有人提議，「複製人」技術既可「起死回生」。雷爾教派公開的「即將誕生複製人」包括傷心家長已死愛兒的複製品，何不把耶穌的臨終壽衣「杜林聖袍」裡面含有的耶穌DNA拿來複製「新耶穌」，那豈不是真正的「耶穌現代復活記」？
夏娃和她「媽媽」的關係，要稱為母女呢？還是「孿生姊妹」？長大後的法律和社會地位如何定位？這是複製人「單性生殖」造成的人倫與社會問題。
按中國傳統說法，人是「父精母血」孕育於天地之間所生，符合「融會陰陽兩性」的原則，剛出世的「現代夏娃」體中只有「陰」性而無「陽」性，今後會是什麼樣子，當然值得觀察。
又，依照天主教的理論，人在「父精母卵」交會受孕那一刻起，就具備靈魂︱將來在母胎成長以及離母胎後獨立成人的動力，天主教以反對「殺生」為由，反對墮胎的道理在此。「現代夏娃」的靈魂（如果有的話）從哪一刻開始進入胚胎？是獨立的「新靈」呢？還是原DNA提供者「本尊」的「分靈」？若沒有靈魂，她活得下去嗎？這又是值得關注的一點。
完全禁止人類複製會不會妨礙科學研究？科學家該不該嘗試複製人？複製人會有什麼結果？你讚不贊成為了幹細胞的研究，去創造「複製的胚胎細胞」？顯然都是從「實用」的觀點來討論，符合美國社會的「務實價值觀。」
不過，複製人盛行會有何結果，這包含科學與推理的問題，一名讀者如下回答：
如果某複製人「出世」的目的就是替某（些）人犯罪，逃避偵查，司法體系能夠防範嗎？如果歐薩瑪．賓拉登多複製幾個約翰沃克（美國塔利班）來滲透西方社會，這可以接受嗎？如果某人殺掉他自己的複製人，取得「分身」的臟腑來延長「本尊」的生命，並且在外國為之分身沒有身份登記，這算不算謀殺？「分身」能否替代「本尊」騙過電腦檢查瞳孔或指紋的安全認證程序？
這些當然是執法問題，更是社會問題和文化價值觀的問題，最後，也是道德問題。科技已發展到可能弄亂社會秩序，顛覆人類演化史的地步。