在臺灣，衛生署疾病管制局局長蘇義仁在參與泰國防制禽流感會議之後，跟農委會主委、衛生署副署長一同前往立法院報告防疫近況。蘇義仁說人類對於禽流感病毒並沒有免疫力，他憂慮一旦禽流感病毒出現變異傳染給人類之後，將會導致短時間內全球數百萬人染病死亡。
蘇義仁：「如果H５N１來的時候，我們會同樣面臨著前期Ｈ１Ｈ２Ｈ３的全球大流行，將有全球幾百萬病人死亡的危險。」
蘇義仁進一步解釋，禽流感病毒從禽鳥之間交互傳染，轉變成禽鳥傳染給人類的三種情況，包括禽鳥傳給豬，又傳給人類；第二種，人類流感傳染給豬，又傳染給家禽；第三種，家禽與人類兩種流感同時爆發，導致流感病毒自身的變異。蘇義仁並且指出廣東省的禽流感疫情變化，正處於高風險期。
蘇義仁：「臺灣禽流感今年流行Ｈ５Ｎ２，屬於閉病源性，這是比較幸運的地方，但是比較憂慮的是我們人類流行性感冒的季節跟禽流感的季節已合在一起。我比較關切的是在廣東、華南地區流行Ｈ５Ｎ１，屬於高病毒性，而且又有人的流感病毒在流行。」
衛生署疾病管制局預測在今年（2004年）的三月到五月間將會有小波的流行。
立法院邀請防疫部門一級主管發表禽流感專題報告，顯見島內正積極準備總統大選的同時，更感受到防疫的壓力。農委會主委李金龍在報告中指出，臺灣由於受到地理位置的影響，未來不排除可能會成為禽流感發生的地區。但強調，臺灣目前並不是高病源性禽流感的疫區。
李金龍：「在我們的西邊有大陸和香港，南邊有越南、泰國、柬埔寨、寮國等等，所以我們是採取高度的警戒。當然我們也不排除高病源性家禽流行性感冒入侵的可能性，我們以最近一年的監測，監測的結果證明，我國目前仍然是高病源性家禽流行性感冒的非疫區。」
而臺灣的行政院則宣布了一系列的防疫因應措施，包括：必要時機，全鳥停止上班上課，準備足夠的棺材等殯葬物料，以及加強查緝走私農產品等等，並且強調禽流感比ＳＡＲＳ更嚴重。
而臺灣政府更質疑大陸方面涉嫌隱匿禽流感的疫情。
行政院發言人林佳龍說：「從ＳＡＲＳ的經驗與教訓，我們知道各國疫情資訊的透明與分享，是疫情能否有效防治的關鍵。而根據瞭解，世界衛生組織也強烈地希望中國大陸政府不要隱瞞疫情而重蹈覆轍，應當要開誠佈公，與世界衛生組織和各國共同來防治疫情的擴大。」
另外，臺灣的家畜試驗所從先前所查獲的大陸走私紅面番鴨的身上，檢測出越南型Ｈ５Ｎ１禽流感病毒，有９７％的ＤＮＡ序列相似。試驗所認為，這一項檢驗報告結果顯示，大陸家禽可能也感染到跟越南病毒極相似的高病源性禽流感病毒。
自由亞洲電臺
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