一些有趣的現象挑戰達爾文

章魚的大眼睛

生活在深海中的兩種動物，章魚和烏賊，他們每天待在漆黑的環境中，大部分跟他們生活在同樣環境的魚類都是盲眼的。奇怪的是，章魚和烏賊的眼部構造，竟然與人類的眼睛大致相同。依照「用進廢退」假設，那麼他們實在用不著這雙大眼睛。按照「適者生存」理論，他們這雙眼睛並不會增加生存競爭力，因此這個例子剛好說明瞭進化論的假設錯誤。

毫無競爭力的寄生蟲

寄生在羊肝中的肝吸蟲，母蟲每次產卵約一千五百萬個左右，卵會隨著羊的糞便排出。它的繁衍方式很特殊，必須有一種蝸牛爬過，卵附著上蝸牛，經由蝸牛移生於植物上，再由羊只吃下植物，回到羊肝中繁殖。在此過程中，一千五百萬個卵大約有十多個卵能存活。這種繁殖過程，在物競天擇中應該不容易與其它物種競爭，但是肝吸蟲幾百萬年來，都是用相同的方法繁殖。

慢吞吞的樹獺

生活在澳洲樹上的樹獺，行動非常緩慢，排泄時必須爬到地上來，雖然它在土地上的排泄有助於增加樹木的養份，但是由於它行動緩慢，地面上的捕食者很容易伺機將其捕捉。有很多動植物的繁殖、生存過程，都有類似這樣不合理的情況，按照物競天擇的說法，應該很容易被淘汰。但是這些動植物早已生存很久了，而且許多動植物的生理結構在百萬年間都沒有重大改變。

始祖馬的疑問

人們常常引用馬的進化作為循序漸進的例子。據說在始新紀的岩層中發現了一種叫做始祖馬的小種四蹄獸化石，於是，進化論者就宣稱它是現代馬的祖先，認為它的特徵與現代馬相符，表示了一種進化形式。然而，事實並不完全支持這個觀點，由於以下原因，我們還不能肯定始祖馬就是現在馬的祖先。

1.始祖馬的化石並沒有在更深層的岩層裡發現，相反的，始祖馬的骨頭卻常常在地層表面找到。2.有人解釋說，始祖馬的體形比現在馬小，可見它是逐漸由小到大，進化到現在馬的。這種說法顯然沒有道理，因為今天存在的馬種仍有大小之分。3.始祖馬和現代馬都同樣有十八對肋骨，而人們認為是中間形態的一種馬（Orohippus）有十五對肋骨，同時另一種中間形態（Pliohippus）卻有十九對肋骨。4.始祖馬的骨骼結構與現代的蹄兔相當類似，這一點並沒有被人們完全認識到。一些科學家相信，始祖馬與馬毫無聯繫，它可能是蹄兔的變種。

總之，化石證據並不能說明生物由低等到高等的進化理論；相反的，許多高等動物卻突然出現在岩石裡，正與神話或傳說中神在很短的時間內創造了萬事萬物的記載相吻合。